Der Bau der zweiten Röhre beeinflusst die umliegende Region, das Urner Oberland und das Leventinatal. Die Umweltverträglichkeit des Projekts ist zwar nachgewiesen, trotzdem ergeben sich unvermeidbare Auswirkungen. Diese werden mit entsprechenden Umweltschutzmassnahmen zur Aufwertung von Lebensräumen und Landschaften in der Region kompensiert.